Plantegener er nemmest at opbevare som frø. Frøene har fra naturens side en relativ lang holdbarhed og så er de små og dermed lette at håndtere. Opbevaringen af frø varetages af NordGen på tre forskellige steder. Det ene sted er i Alnarp i Sverige, hvor frøene tørres, pakkes og gemmes til at nogen senere skulle ønske at gøre brug af dem. Det andet sted er i en nedlagt kulmine på Svalbard. Frøene på Svalbard fungerer som en slags ”sikkerhedskopi”, hvis nu en menneskelig fejl eller en naturkatastrofe kom til at ødelægge frøene i Alnarp. Og sidst men ikke mindst har NordGen siden 2007 haft, et lager af basissamlingen ved Det Jordbrugsvidenskabelige fakultet i Årslev på fyn.